公司入职协议的注意事项有：
1.了解用人单位的名称、住所和法定代表人或者主要负责人;
2.了解工作内容和工作地点以及工作时间和休息休假;
3.看清劳动纪律;
4.避免陷阱合同，约定好双方享有的权利与义务。

根据《劳动合同法》第七条，用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系。用人单位应当建立职工名册备查。