公司暂时扣押工资是不合法的。公司或用人单位不能随意克扣劳动者的工资，且支付给劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。如果公司存在克扣或者无故拖欠劳动者工资的情况，劳动者可以向劳动行政部门投诉，由劳动行政部门责令公司支付劳动者的工资和经济补偿，并可责令其支付赔偿金。

《劳动法》第九十一条：用人单位有下列侵害劳动者合法权益情形之一的，由劳动行政部门责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金：（一）克扣或者无故拖欠劳动者工资的；（二）拒不支付劳动者延长工作时间工资报酬的；（三）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；（四）解除劳动合同后，未依照本法规定给予劳动者经济补偿的。

《工资支付暂行规定》第十八条：各级劳动行政部门有权监察用人单位工资支付的情况。用人单位有侵害劳动者合法权益行为的，如克扣或者无故拖欠劳动者工资，劳动行政部门可责令其支付劳动者工资和经济补偿，并可责令其支付赔偿金。

如果公司暂时扣押了你的工资，建议先与公司进行协商，协商不成可以向劳动行政部门投诉，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼。在维护自己权益的过程中，请保留好相关证据，以便在需要时提供证明。

法律依据

《中华人民共和国劳动法》第九十一条 用人单位有下列侵害劳动者合法权益情形之一的，由劳动行政部门责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金：
(一)克扣或者无故拖欠劳动者工资的;
(二)拒不支付劳动者延长工作时间工资报酬的;
(三)低于当地最低工资标准支付劳动者工资的;
(四)解除劳动合同后，未依照本法规定给予劳动者经济补偿的。

《《工资支付暂行规定（1994年版）》》第十八条 各级劳动行政部门有权监察用人单位工资支付的情况。用人单位有下列侵害劳动者合法权益行为的，由劳动行政部门责令其支付劳动者工资和经济补偿，并可责令其支付赔偿金： （一）克扣或者无故拖欠劳动者工资的； （二）拒不支付劳动者延长工作时间工资的； （三）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的。 经济补偿和赔偿金的标准，按国家有关规定执行。