企业申请工伤认定程序如下:

(一)申请，单位申请或职工或其近亲属申请；

(二)受理，如职工或其近亲属的申请超过一年的期限，或不符合管辖权规定，社会保险行政部门将不予受理；

(三)调查对职工或其近亲属提出工伤认定申请的，社会保险行政部门对用人单位发出《举证通知书》；

(四)认定社会保险行政部门应在正式受理之日起60日内作出认定结论。