违反劳动法的合同处理方式需结合合同条款效力、协商程序及法律救济途径分层解决，具体步骤如下：

部分无效原则

根据《劳动合同法》第二十六条、第二十七条，若合同中仅有部分条款违反法律（如超长工时、工资低于最低标准等），则该条款无效，不影响其他合法条款的效力。例如，合同约定“每天工作12小时”违法，但其他关于岗位和工资的条款仍有效。

整体无效情形

若合同整体违反法律法规（如强迫签订“生死条款”、未约定社会保险等），可能导致合同全部无效，劳动者可主张重新签订或要求用人单位承担赔偿责任。

协商修改违法条款

劳动者可与用人单位协商修改违法条款（如调整工作时间、补足工资差额等），并签订书面补充协议。

若单位拒绝协商，劳动者需保存沟通记录（如邮件、聊天记录）作为后续维权证据。

向劳动监察部门投诉

携带劳动合同、工资条、考勤记录等证据，向当地劳动保障监察大队投诉。

监察部门有权责令单位限期整改，逾期不整改的将面临行政处罚（如罚款、列入失信名单）。

申请劳动仲裁

若协商与投诉均未解决争议，劳动者可在1年内向劳动合同履行地或单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。

仲裁请求示例：确认违法条款无效、补发工资差额、支付加班费、补缴社保等。

证据要求：需提供劳动合同原件、工资流水、工作沟通记录等（电子证据需打印并公证）。

提起诉讼

对仲裁结果不服的，可自收到裁决书之日起15日内向法院起诉。

法院判决后，若单位仍不履行，劳动者可申请强制执行。

若用人单位存在以下情形，劳动者可主张赔偿：

工资违法：克扣或拖欠工资的，需补发并加付25%经济补偿；低于最低工资的，差额部分需补足。

违法解除合同：需支付双倍经济补偿金（N×2），并赔偿工资损失（应得工资+25%赔偿费）。

未缴社保：可要求补缴社保，若因未缴导致损失（如医疗费无法报销），可主张赔偿。

证据留存：保留劳动合同、工资发放记录、加班审批单、工作聊天记录等，电子证据需及时备份。

时效限制：劳动仲裁申请需在争议发生之日起1年内提出，超期可能丧失胜诉权。

维权成本：劳动争议仲裁不收费，诉讼阶段费用较低（10元/件），劳动者可申请法律援助。

总结：处理违法劳动合同时，优先协商修改，协商不成则通过投诉、仲裁、诉讼逐步推进。劳动者需主动收集证据，并在法定时效内主张权利，以最大限度维护自身权益。

法律依据

《中华人民共和国劳动合同法（2012修订）》第二十六条 【劳动合同的无效】下列劳动合同无效或者部分无效：
(一)以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立或者变更劳动合同的;
(二)用人单位免除自己的法定责任、排除劳动者权利的;
(三)违反法律、行政法规强制性规定的。
对劳动合同的无效或者部分无效有争议的，由劳动争议仲裁机构或者人民法院确认。